primer premier破解

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北京天演融智软件有限公司

Primer Premier是设计和分析PCR引物的较全面的软件。Primer Premier通过利用较接近的热力学算法和较精确的熔化温度,找到较优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告较佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很*地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让Primer Premier为您挑选较好的引物。


自动同源性和避免模板结构

Primer Premier自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有显着交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您*的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特异性,避免模板结构提高设计引物的效率。


手动引物搜索

Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户较终选择的引物。


Primer Premier是一款由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计,评估的软件,其主要界面是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif)。

Primer Premier软件的主要功能分四种,即引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。**种为其主要功能。此外,该软件还有一些特殊功能,其中较重要的是设计简并引物,另外还有序列"朗读"、DNA 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。

Primer Premier软件还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择,有纤毛虫大核(Ciliate Macronuclear)、无脊椎动物线粒体(Invertebrate Mitochondrion)、支原体(Mycoplasma)、植物线粒体(Plant Mitochondrion)、原生动物线粒体(Protozoan Mitochondrion)、一般标准(Standard)、脊椎动物线粒体(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母线粒体(Yeast Mitochondrion)。

Primer Premier软件有优秀的引物自动搜索功能,同时可进行部分指标的分析,而且*使用,已被引物设计行业人士认为是一款相当不错的软件。


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